http://www.squared5.com/ ОТЛИЧНАЯ БЕСПЛАТНАЯ ПРОГА для макос и винды!
сам ей регулярно пользуюсь для конвертации mov файлов в различные другие контейнеры с необходимыми кодеками! Поддерживает двухпотоковое сжатие, так что процесс не быстрый , но при правильных настройках качественный!
Кодирую для заливки на youtube, vimeo и для просмтора на ТВ Самсунг (6-й серии)